Natural de Beniaján (Murcia), comienza sus estudios musicales en la Academia de Música con el profesor José Miguel Peñarrocha Desco, continuándolos en el Conservatorio Superior de Música de Murcia con los profesores Juan F. Cayuelas Grao y Manuel Guerrero, terminándolos con las más altas calificaciones, obteniendo diversas Matrículas de Honor y Premios Fin de Grado en Flauta y Música de Cámara.
Realiza cursos de perfeccionamiento con los profesores Istvan Matuz, Aurele Nicolet, Pierre Ives Artaud, Joaquín Gericó Trillo, Frank Theuns, Jaime Martín, Vicent Prats y Magdalena Martínez. En el año 2003, fue seleccionado como único interprete español para participar en la Master Class impartida en Reggio Emilia (Italia), por Sir James Galway, considerado como uno de los mejores flautistas del mundo.
En su trayectoria artística, ha sido primer flauta en la Orquesta de Jóvenes de la Región de Murcia, Orquesta Sinfónica del Conservatorio Superior de Música de Murcia y Orquesta de la Región de Murcia, bajo la dirección de Manuel Hernández Silva.
Ha actuado bajo la batuta de grandes maestros como Odón Alonso, José Collado, Enrique García Asensio, Leo Brower, Tamas Vasâry, entre otros, y junto a artistas de la talla de Carlos Moreno, Mario Monreal, Narciso Yepes, Vicente Amigo, Michel Camilo, Ainhoa Arteta, Monserrat Caballé y Rocío Jurado (en el Amor Brujo de Falla).
Como solista ha interpretado con la Orquesta Ciudad de Elche, obteniendo gran éxito de público y crítica, con la Orquesta Sinfónica de la Región de Murcia y ha sido invitado a participar como solista en el Festival Internacional de Música del Mediterráneo en el Concierto para dos flautas de A. Stamitz, así como en diversos grupos de cámara, entre ellos, el Quinteto de viento F. Danzi o el Dúo de flauta y piano Nicolás-Casanova, con el cual actuó en la ‘Fundación Juan March’ y en países como Francia, Italia y Alemania, etc.
En septiembre de 2005 actuó con la Wiener Mozart Orchester en la prestigiosa Musikverein (Sala Dorada) de Viena.
El 13 de marzo de 2008 estrenó en Córdoba el Concierto para Flauta y Orquesta, que el maestro Manuel Moreno-Buendía dedicó al propio Juan Antonio Nicolás, con la Orquesta de dicha ciudad y su director titular, Manuel Hernández Silva; obra que volvió a subirle al escenario como solista en diciembre de 2009, esta vez del Auditorio Víctor Villegas de Murcia, en el Concierto conmemorativo de la Constitución Española.
En junio de 2013 colaboró con la Metropolitan Festival Orchestra de Singapur.
En la actualidad, es profesor de flauta travesera en el Conservatorio Profesional de Música ‘‘Mariana Baches’ de Pilar de la Horadada (Alicante) y flauta solista y miembro fundador de la Orquesta Sinfónica de la Región de Murcia.